Anwendungen

• De novo Assemblierung von Hefe (< 20 Mb)
• Keine Referenz-Sequenz wird benötigt
• Spezies-Bestimmung
• Proben Reinheits-Check nach der Assemblierung

Premium Service

• Möchten Sie ihr eigenes Projekt zusammenstellen - zum Beispiel mit mehr oder weniger Daten pro Genom? Oder benötigen Sie Pod5 Dateien? Dann bestellen Sie gerne unseren Premium-Service

Mehr erfahren  >>

  Kostenlose Barcodes bestellen

Bitte verwenden Sie folgende Volumina und Konzentration, wenn Sie uns ihre Hefe-Proben schicken:

Bitte beachten Sie: Proben, die unsere Konzentrationsanforderung nicht erfüllen, könnten beim Sequenzieren fehlschlagen. Es erfolgt keine Wiederholung für fehlgeschlagene Proben aufgrund einer falschen Konzentrationseinstellung.

Für die DNA-Probenvorbereitung ist ein qualitativ hochwertiges, säulenbasiertes DNA-Präparationskit ausreichend.

 
Bitte senden Sie Ihre Probenröhrchen gemäß den folgenden Anforderungen:

• Verwenden Sie 1,5 ml Safe-Lock-Röhrchen für Ihre Proben.
• Stellen Sie Ihre Proben entweder in nukleasefreiem Wasser oder in Elutionspuffer (10 mM Tris, pH 8,5) bereit.
• Bitte verwenden Sie kein Nanodrop zur Konzentrationsmessung. Spektrophotometrische Methoden sind für die Quantifizierung unzuverlässig. Verwenden Sie stattdessen eine fluorometrische Methode wie Qubit.
• Kleben oder umwickeln Sie die Röhrchen nicht mit Parafilm. Safe-Lock-Röhrchen bieten einen optimalen Verschluss und Schutz vor Verdunstung.
• Beschriften Sie Ihre Probenröhrchen mit unseren kostenlosen Barcode-Etiketten. Bringen Sie das Etikett waagerecht an.

Wie und wohin Sie Ihre Proben versenden:

• Nutzen Sie entweder eine unserer DropBoxen in Ihrer Nähe für eine kostenlose Probenabholung oder einen Kurierdienst Ihrer Wahl.
• Sie können bequem eine unserer Versandoptionen für Proben nutzen
• Verwenden Sie für den sicheren Versand unserer Proben unsere Probenbeutel und -boxen.
• Senden Sie Ihre Proben an unser Eurofins Genomics Sequenzierlabor in Köln, Deutschland.

Bitte stellen Sie sicher, dass Ihre Probe frei von Verunreinigungen ist (z. B. Ethanol), die Ihre Ergebnisse negativ beeinflussen könnten. Eine vollständige Liste möglicher Verunreinigungen finden Sie hier: https://community.nanoporetech.com/contaminants 

Datenbereitstellung & bioinformatische Analyse

Folgende Dateien werden für jedes Hefegenom geliefert:

• Umfassender Analysebericht mit Assemblierungsstatistiken und Qualitätskontrolle im HTML-Format
• FASTQ-Rohdaten, die mit der Konsensussequenz übereinstimmen
• Assemblierte Genomsequenz im FASTA-Format
• Zirkuläres Genomdiagramm als publikationsreifes PNG
• Annotierte Genomsequenz aller Contigs im GENBANK-Format (direkt importierbar in Ihre bevorzugte Software wie Sanger's Artemis, SnapGene, Geneious Prime, Benchling, SeqBuilder Pro etc.)
• Annotierte Genommerkmale im GFF3-Format
• Annotierte Merkmaltabelle, einschließlich der Nukleotidsequenz jedes Merkmals
• Nukleotidsequenzen aller Gen-Sequenzen im FASTA-Format
• Aminosäuresequenzen aller annotierten Proteinsequenzen im FASTA-Format

Ihre Daten werden sicher über Ihr Ecom-Konto bereitgestellt

Keine Bereitstellung von: Pod5- oder FASTQ-Dateien, die nicht ausgerichtet sind.

Wenn Sie an Pod5-Dateien und nicht-ausgerichteten FASTQ-Dateien interessiert sind,  kontaktieren Sie uns bezüglich unseres Premium-Services.

Lieferzeit

Die Bearbeitungszeit für die Hefegenom-Sequenzierung beträgt bis zu 10 Werktage.

Sie werden per E-Mail informiert, sobald Ihre Ergebnisse in Ihrem Ecom-Konto verfügbar sind.

Verwandte Produkte