INVIEW Resequencing

INVIEW Resequencing - Perfekte Pakete
für verschiedene Genom-Größen

Resequenzierung Ihres Organismus geht jetzt ganz einfach.

Das INVIEW Resequencing Produkt ist für alle Genome bis zu einer Größe von 180 Mb erhältlich.

Die Größe des Genoms und die Anzahl der Proben sind die einzige Voraussetzung um eine Next Gen basiertes Resequenzierung in Auftrag zu geben.

Anwendungen

Resequenzierung ganzer Genome
Identifizierung von genetisches Varianten, Einzelbasenmutationen, Insertionen oder Deletionen
Züchtungsstudien
Genetische Pathwayanalysen
Optimierung von Produktionsstämmen
Metabolic engineering

Besonderheiten

Garantierte Coverage für Ihre Probe
- 100 x für Bakterien
- 70 x für Hefen
- 30 x für alle größeren Genome
Ab 1 Probe erhältlich
Kurze Lieferzeiten - ab 12 Werktagen
UDI's (Unique dual indexing) ermöglichen hochwertige Daten
Datentransfer mittels "secure FTP"

Bakterien-Genom-Sequenzierung

Für qualitativ hochwertige und vollständige de novo Assembly, große Struktur-Varianen und die Analyse von modifizierten "Base Calls" empfehlen wir unseren Long Read Bacteria WGS Service.
Für Hybrid-Assemblierungen von kurzen und langen Reads (Polishing der langen Reads), finden sie alle Informationen auf der Hybrid Assembly Bacteria Seite.

Produktspezifikationen & Bestellung

Hier ist die Übersetzung ins Deutsche:

Illumina-kompatible DNA-Bibliotheksvorbereitung unter Verwendung der Unique Dual Indexing-Technologie:

Technologie: Illumina NovaSeq 6000 oder NovaSeq Xplus
Lauftyp: paired-end
Leselänge: 2 x 150 bp
Vordefinierte Lesepakete (Vielfache von 5 Mio. Lese-Paaren), je nach Bedarf empfehlen wir die folgende Abdeckung:
- Keimbahn/häufige Variantenanalyse: 30-50x
- Somatische/seltene Varianten: 100-1000x
- De-novo-Assembly: 100-200x

Hinweis: Die Abdeckung wird mit der Formel berechnet:

Leselänge / Gesamtzahl der Reads÷ Genomgröße

Beispiel: Das Sequenzieren eines Genoms von 5 Mb mit 5 Millionen Read Paaren bei einer Leselänge von 2 × 150 bp ergibt eine Abdeckung von 300×.

Probentyp: Genomische DNA (RNA-frei)
Mindestmenge: 600 ng
Volumen: bis zu 200 µL
Konzentration: >3 ng/µl
Reinheit (OD260/280): 1.8-2.0
Resuspensionspuffer: Wasser, EB oder niedriges TE (<0.1 mM EDTA)
Format: Barcode-markierte 1,5 ml Safe-Lock-Röhrchen; oder für > 48 Proben in Eppendorf twin.tec PCR Plate 96, full-skirted, Positionen G12 & H12 leer lassen
Versandmethode: Raumtemperatur

Varianzanalyse: Erkennung und Annotation von Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs) sowie Insertionen und Deletionen (InDels)
De novo-Genomassemblierung (nur für haploide Organismen)