Häufig gestellte Fragen zu Produkten und Dienstleistungen

Unsere eigens entwickelte Software GENEius ermöglicht es uns, gelieferte Aminosäure- oder DNA-Sequenzen zu optimieren und beispielsweise an die Codon Usage von beliebigen Organismen anzupassen. Ebenso werden GC-Gehalte angepasst und Repeat- und Hairpin-Strukturen vermieden.
Für Kunden steht unsere GENEius Software online frei zur Verfügung.

Wir können Fragmente in jeder Länge synthetisieren. Bitte kontaktieren Sie uns für Ihr individuelles Angebot.

Oligonukleotide sind aufgrund der Synthesechemie in ihrer Länge begrenzt (maximal 120 – 200 Basen lang) und einzelsträngig. Ein synthetisches Gen kann bis zu mehrere tausend Basenpaare lang sein, ist doppelsträngig und kann sowohl linear als auch in einem Vektor kloniert vorliegen.

Es liegt in der Natur der Sache, dass jedes PCR-Produkt aus einem Gemisch aus korrekten und inkorrekten Sequenzen besteht. Aus diesem Grund enthalten nach der Subklonierung nicht alle Klone die erwartete Sequenz. Wir empfehlen daher die Analyse von sechs bis zwölf Klonen für Gene von 300-950 bp.

Gene, die Sie bei uns klonieren lassen, enthalten ausschließlich korrekte Sequenzen. Sie erhalten somit eine Glycerinkultur eines 100%-ig korrekten Klons.

Ja. Zusätzlich zu der Klonierung in unsere Standardvektoren bieten wir die Klonierung in jeden beliebigen Vektor beispielsweise in Expressionsvektoren Ihrer Wahl an.

Bitte senden Sie Ihren spezifischen Vektor¹ für die Subklonierung zusammen mit dem Ausdruck der Bestellbestätigung an die folgende Adresse:

Eurofins Genomics
Gensynthese Labor
Anzinger Str. 7a
85560 Ebersberg
Deutschland

¹ Es sollten mindestens 10 µg Vektor DNA vorliegen - lyophilisiert oder gelöst (c=200 ng/µl).

• Mini Scale Plasmid-Präparation: 1-10 µg Plasmid-DNA
• Midi Scale Plasmid-Präparation: 15-50 µg Plasmid-DNA
• Maxi Scale Plasmid-Präparation: 100-500 µg Plasmid-DNA
• Mega Scale Plasmid-Präparation: 500 µg-2.5 mg Plasmid-DNA
• Giga Scale Plasmid-Präparation: up to 10 mg Plasmid-DNA

Mehr Informationen zu unserem Plasmid-Präparations-Service finden Sie hier.

Wir verifizieren jedes synthetische Gen über Doppelstrang-Sequenzierung in unserer hausinternen Sequenzierabteilung. Wir garantieren eine Sequenzgenauigkeit von 100% für jedes klonierte Gen.

Der hohe Qualitätsstandard unserer Dienstleistungen wird durch professionelles Qualitätsmanagement gewährleistet. Wir sind nach DIN EN ISO 17025 akkreditiert und nach ISO DIN EN 13485 und GLP zertifiziert.

Lieferzeiten für Gene

Unsere Standardlieferzeiten (zuzüglich eines Versandtages) sind für:

Die Lieferzeiten für unsere Express Gene sind:

 
Lieferzeiten für GeneStrands

Die synthetisch lineare dsDNA wird als Fragment ausgeliefert.

Lieferzeiten für SARS-CoV-2 Gene

Lieferzeiten für SARS-CoV-2 GeneStrands

Der komplette Gensynthese-Prozess angefangen von der Oligonukleotidproduktion über die Gensynthese selbst bis hin zur DNA-Sequenzierung wird bei Eurofins Genomics hausintern durchgeführt. Dadurch können wir eine 100%-ige Geheimhaltung garantieren.

Standard und Komplexe Gene können ganz einfach über unser Ecom System bestellt werden.

Alternativ können Sie auch anhand unserer Angebotsformulare auf unserer Website Ihre Anfrage übermitteln. Dies gilt auch für Genbiblioteken.

Nach Eingang Ihrer Anfrage kontaktieren unsere Experten Sie umgehend.

Sollten Sie Ihre Bestellung über unser Ecom System platziert haben, können Sie den Bestellstatus nachverfolgen.

In Ihrem persönlichen Ecom Account sind alle Ihre Bestelldaten für Sie gespeichert und können zu jeder Zeit abgerufen werden.

Ihre Bestellhistorie erreichen Sie, indem Sie auf "my orders" klicken. Hier sehen Sie Ihre Bestellbestätigung und können zudem über einen Zeitraum von zwei Jahren Informationen zu Ihren Bestellungen nachverfolgen.


Sollten Sie hierzu Fragen haben steht Ihnen unser Customer Support Team gerne zur Verfügung.

Die GeneStrands-Bestellseite ermöglicht neben der Einzeleingabe von Genen, einen Datei-"Upload" und eine "Copy&Paste" Dateneingabe, die gerade bei der Bestellung vieler GeneStrands sehr hilfreich ist.

Falls Sie Gensequenzen als FASTA format vorliegen haben, so nutzen Sie bitte das "Copy&Paste" Eingabeformat.

Falls Sie FASTA Sequenzen über die Einzeleingabe einkopieren wollen, stellen Sie bitte sicher dass sich keine Umbrüche in der Sequenz befindet.

• Kopieren Sie ihre FASTA Sequenz in ein leeres Microsoft Word Dokument
• Ersetzen Sie die Zeilenümbrüche "^p" durch ein Leerzeichen (blank)
• Dann kann die Sequenz aus Word direkt in das Sequenzfeld der Bestellseite einkopiert werden.

Synthetische Gene können beispielsweise für die Anpassung der Codon Usage zur Optimierung der Gen-Expression, zur Überexpression von Proteinen, für Protein-Engineering, sowie als Standards für Real Time PCR und PCR-Analysen verwendet werden. Synthetische Gene können auch zur Konstruktion von Hybrid-Genen oder zur Produktion von DNA-Impfstoffen dienen. Weiterhin können multiple Varianten eines Gens hergestellt werden.

Die gewünschte Sequenz, welche beispielsweise für ein künstliches Protein kodiert, wird in eine Reihe von überlappenden Oligonukleotiden unterteilt. Um das bestmögliche Ergebnis zu erzielen, sollte die Sequenz der zu assemblierenden Oligonukleotide sorgfältig unter Einhaltung folgender Gesichtspunkte gewählt werden:

• die Bildung von Hairpin-Strukturen innerhalb der Oligonukleotide sollte vermieden werden
• wenn hohe Expressionsraten erwünscht sind (beispielsweise für die Protein-Produktion) sollten Sequenzen vermieden werden, die seltene Codons in ein Gen einführen
• Oligonukleotide mit eindeutigen Restriktionsschnittstellen können für anschließende Manipulationen durch rekombinante DNA-Techniken von Vorteil sein.

Eurofins Genomics verwendet die urheberrechtlich geschütze Software GENEius für das Design der Oligonukleotide.

Grundsätzlich gibt es drei verschiedene Ansätze für das Assembly synthetischer Gene.
In dem von Khorana (Gupta et al. 1968) entwickelten Ansatz wird eine Reihe von überlappenden Oligonukleotiden synthetisiert. Durch das Annealing der Oligonukleotide, bildet sich ein doppelsträngiges DNA-Fragment mit vereinzelten Lücken in beiden Strängen. Diese Lücken werden anschließend mittels einer DNA-Ligase geschlossen. Die DNA-Ligase ist ein Enzym, das eine Phosphordiester-Brücke zwischen dem 5`-Phosphat eines doppelsträngigen Oligonukleotidfragments und dem 3`-Hydroxyl-Ende eines anschließenden doppelsträngigen Oligonukleotidfragments bildet.

Ein zweiter, häufig angewandter Ansatz wurde von Narang (Scarpulla et al. 1982) entwickelt. Diese Methode macht sich der Template-gerichteten, Primer-abhängigen 5’-3’-Synthese-Fähigkeit der DNA-Polymerase I (Klenow-Fragment) zu Nutze. Nach Annealing der Enden der langen Oligonukleotide, füllt die Polymerase die Lücken mit dNTPs auf. Vereinzelte Lücken im Doppelstrang werden anschließend mit DNA-Ligase geschlossen.

Eine alternative Strategie basiert auf der Möglichkeit, sehr lange Oligonukleotidketten herstellen zu können. Bei diesem Ansatz (Rossi et al. 1982) werden zwei Oligonukleotide mit überlappenden 3’-Enden konstruiert. Dieses Konstrukt wird durch die DNA-Polymerase zum Doppelstrang vervollständigt. Nach der Polymerisation können überhängende Enden mittels Restriktionsverdaus generiert werden.

Gewöhnlich werden neu synthetisierte Fragmente und Gene anschließend in einen Vektor kloniert. Zu diesem Zweck ist es notwendig, bei dem Oligonukleotid-Design alle Klonierungsschritte zu beachten. Größere Fragmente können in Untereinheiten unterteilt werden, welche dann separat assembliert werden. Nach der Verifikation der Sequenzen der Untereinheiten werden diese zum Gesamtfragment assembliert.

Wenn die Mutationen zahlreich und über die gesamte Sequenz verteilt sind, empfehlen wir die
De Novo Synthese. Die De Novo Synthese ermöglicht es zusätzlich, andere Eigenschaften der Sequenz anzupassen bzw. zu optimieren, wie beispielsweise die Codon Usage, den GC-Gehalt oder Restriktionsstellen.

Die ortsgerichtete Mutagenese ist anzuraten, wenn nur wenige Modifikationen vorliegen und/oder diese in einem eng begrenzten Bereich innerhalb der Sequenz gebündelt sind.

Jedes bp hat ein spezifisches Molekulargewicht - im Durchschnitt 0,65 Kilodalton. Für ein Plasmid mit 3.000 bp Länge kann das Molekulargewicht wie folgt berechnet werden: 3.000 bp x 0,65 kD pro bp = 1.950 kDa.

Wenn Sie ein synthetisches Gen mit beispielsweise 1.000 bp Länge bestellen, ist dieses in unseren Standardvektor pEX-A2 (2.450 bp) kloniert. Das Molekulargewicht für das entsprechende 3.450 bp Plasmid beträgt dann 2.243 kDa.

Ja. Synthetische Gene und GeneStrands werden auf offenen Robotor produziert. Hier kann man die Möglichkeit einer sehr geringen Kreuzkontamination in seltenen Fällen nicht ausschließen. Wir haben einen täglichen Reinigungs- und Dekontaminationsprozess entwickelt, der solche Fälle so gut wie möglich ausschließen soll. Sollten Sie allerdings mehrere qPCR / sensitive PCR Kontrollen in einer Bestellung haben, empfehlen wir, uns vor der Bestellung zu kontaktieren, um ihre Anforderungen vorab zu besprechen.