INVIEW Liquid Biopsy Oncoprofiling

Zuverlässige Erkennung von krebsassoziierten Mutationen in 728 Genen aus Liquid-Biopsie-Proben

INVIEW Liquid Biopsy Oncoprofiling (728 Gene) bietet das umfassendste Krebsgenpanel von Liquid-Biopsie-Proben weltweit.

Der Service deckt vollständig die Exons von 728 krebsrelevanten genomischen Regionen ab, einschließlich protein-codierender Gene,und ausgewählter Promotorregionen. Der Service ist der erste seiner Art, der die Erkennung struktureller Varianten, einschließlich Kopienzahlvariationen und Fusionsereignissen von zirkulierender Tumor-DNA (ctDNA) ermöglicht. Die breite Abdeckung von onkogenen Veränderungen ermöglicht die nicht-invasive Untersuchung nahezu jeder Art von Tumor.

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Industrieoptimiert

Anwendungen

Nicht-invasive Screening für klinisch relevante tumorassoziierte Mutationen
Vergleich von gepaarten Proben aus Tumorbiopsien und Liquid-Biopsien
Forschung zu Mechanismen des Krebsfortschritts

Besonderheiten

Screnning von ctDNA, isoliert aus Blutplasma, für 728 wichtige krebsassoziierte Gene
Effiziente Erfassung aller Exons der gezielten Gene
Analyse struktureller und Kopienzahlvarianten (siehe "Produktdetails")
Führende Sequenzabdeckung und Gleichmäßigkeit in der Branche
Nachweisgrenze (LOQ) bis zu einer Allelfrequenz von 1%^#

Spezifikationen

Reproduzierbare Analyse von zellfreier DNA (cfDNA) von wichtigen tumorassoziierten Mutationen in 728 protein-kodierenden Genen, ausgewählten Promotorregionen, miRNAs und 282 extra-exonischen Varianten (Introns, regulatorische Regionen, nicht-übersetzte Regionen (UTRs) und intergenische Regionen)
Genaue Charakterisierung von einzelnen Nukleotid-Polymorphismen (SNPs) und Insertionen und Deletionen (InDels)
Eigene Protokolle für die cfDNA-Extraktion und Bibliotheksvorbereitung aus Plasmaproben
Hervorragende Zielanreicherungseffizienz durch optimierte Hybridisierungstechniken mit der neuesten Agilent SureSelect Chemie
Hochsensitiver Test mit einer unteren Nachweisgrenze von bis zu 1% Tumor-Allelfrequenz^#
Möglichkeit zur Analyse von Kopienzahlvariationen (CNV)*

*Die CNV-Analyse mit INVIEW Liquid Biopsy Oncoprofiling (728 Gene) muss mit der entsprechenden Kontrollgruppe durchgeführt werden. Bitte senden Sie uns Plasmaproben von mindestens sieben anderen Patienten/Personen, um somatische CNVs in einer gegebenen Probe korrekt zu identifizieren.

^#Je nach Qualität der Eingabe-DNA und genomischer Region kann die LOD möglicherweise >1% sein.

>> FAQ's OncoProfiling

>> Proben- vorbereitung

Produktspezifikationen & Bestellung

Aktzeptiertes Ausgangsmaterial

Akzeptiertes Ausgangsmaterial für INVIEW Liquid Biopsy Oncoprofiling (728 Gene):

10 ml Blut
4 ml Plasma*
15 ng bereits isolierte zellfreie DNA (bis zu 30 µl / Konzentration > 0,5 ng/µl)

* Wenn möglich, stellen Sie bitte eine zusätzliche Aliquot bereit. Bereiten Sie das Plasma gemäß dem bereitgestellten Protokoll vor (siehe Dateien). Versenden Sie das Plasma auf Trockeneis. Das Auftauen des Plasmas führt zur Degradation der zellfreien DNA (cfDNA).

Technologie

Auf Hybridisierung basierte Erfassung von Zielregionen mit firmeneigenen Protokollen und der hochmodernen Technologie SureSelect von Agilent
Next Generation Sequenzierung auf der Illumina-Plattform

Gelieferte Ergebnisse

FastQ-Dateien (Sequenzen und Qualitätswerte)
Alignment-Datei (BAM)
SNP- und InDel-Tabellen einschließlich annotierter Varianten und Auswirkungen (VCF, TSV, BED)
Tabellen über Gewinn- und Verlust-Ereignisse der Genkopien (tsv)
Tabelle der Genfusionsereignisse (tsv)
Umfassender Datenanalysebericht (PDF)

Zusätzliche Informationen

Zusätzliche Informationen

INVIEW Liquid Biopsy Oncoprofiling (728 Gene) bietet den tiefsten Ansatz für die Profilierung von Tumormutationen aus zellfreier (cfDNA) Plasma mittels eines gezielten Krebsgen-Panels.

Als leistungsstarkes nicht-invasives Werkzeug ermöglicht dieses Tumorpanel die Überwachung von krebs-spezifischen Mutationen mit hoher Genauigkeit und Sensitivität. Das analysierte Material, ctDNA, wird als ein spezifischer und sensibler Biomarker in verschiedenen menschlichen Krebsarten beschrieben, was eine umfassende molekulare Profilierung des Tumors ermöglicht.

Dieses Krebspanel ermöglicht die Detektion von 728 klinisch relevanten genomischen Regionen, einschließlich häufig mutierter Gene wie BRAF, KRAS, EGFR, PIK3CA, HER2 und TP53. Der Umfang dieses Mutationspanels macht das Produkt perfekt geeignet für die Untersuchung nahezu jeder Art von Krebs, einschließlich Melanom, Blasenkrebs, Eierstockkrebs, Brustkrebs, Dickdarmkrebs, Prostatakrebs, Schilddrüsenkrebs, Nierenkrebs, Leberkrebs und Lungenkrebs.

Weiterführende Links

Complete portfolio overview for Oncology

Blog article: Human exome sequencing with lower coverage and better costs

Blog article: How to handle clinical samples for successful exome sequencing